Первая крупная работа В.И. Вернадского так и называлась – «Основы кристаллографии». Ко времени выхода ее в свет эта наука достигла значительных успехов, но Вернадский осмыслил ее с новых позиций – с позиции физики, а не геометрии. Для Вернадского кристалл – это «особая активная среда, одно из состояний, для которого характерна неоднородность физических свойств в разных направлениях».
Будучи профессором минералогии Московского университета, В.И. Вернадский сочетал преподавание с регулярными научными экспедициями, в том числе и в Крым. Именно оттуда, с горного перевала Байдарские ворота, в 1899 г. был привезен этот огромный кристалл кальцита, его длина – 23 см.
Кальцит – один из самых важных и распространенных минералов на Земле. Он занимает около 4% веса земной коры и представляет собой одну из природных форм карбоната кальция.
В чистом виде кальцит белый или бесцветный, прозрачный или просвечивающий – в зависимости от степени совершенства кристаллической структуры. Примеси окрашивают его в разные цвета. Желтоватый цвет, как правило, придают примеси железа. Формы кристаллов кальцита очень разнообразны. Одной из наиболее распространенных является скаленоэдр (от греческого "скалена" – треугольник) – двенадцатигранник с гранями в виде неравносторонних треугольников.
